《最后生还者》故事设定在现代文明被摧毁后的美国。主角乔尔是一名坚韧且饱经沧桑的走私者，他受雇护送年轻女孩艾莉穿越危险重重的美国。艾莉看似普通，实则有着惊人秘密——她对致命的 Cordyceps 真菌病毒免疫，而这种病毒已将大部分人类变成了恐怖的怪物。 一路上，乔尔和艾莉遭遇了各种危险，有被病毒感染失去理智的怪物，也有自私自利、不择手段的人类团伙。他们在废弃的城市、荒芜的乡村中艰难求生，每一步都充满了挑战。在相处过程中，乔尔从起初只是为了完成任务，逐渐与艾莉建立起了深厚的类似父女的情感纽带。 随着旅程推进，他们发现艾莉的免疫或许是人类生存的关键希望，但背后也隐藏着复杂的阴谋和残酷的真相。两人在不断的冒险与挣扎中，不仅要对抗外界的威胁，还要面对内心的恐惧与道德的抉择。